水產養殖動物疾病的種類很多，其中以病毒性疾病（淋巴囊腫、皰疹病毒病、傳染性胰腺壞死病、病毒性出血敗血癥等）、細菌性疾病（弧菌病、白皮病、鏈球菌病等）、真菌性疾病（水霉病、鰓霉病、魚醉菌病等）和寄生蟲（盾纖毛蟲、小瓜蟲、隱核蟲等）引起的疾病zui常見，在防治過程中大量使用漁藥（藥物）導致藥物殘留。
 
    養殖者對藥物使用和藥物特性認識不足，用藥劑量、給藥方法不遵守用藥規定，或使用未經批準的藥物，甚至濫用藥物，致使養殖水產品質量安全無法保障。少數飼料加工企業為了追求自身利益的zui大化，在飼料中添加一些磺胺類、硝基呋喃類、喹惡啉類和硝基咪唑類等禁止使用的抗菌藥物及甲基睪丸酮、雌激素等激素類藥物，投喂造成養殖產品的藥物殘留。凡是藥物都具有一定毒性，如果使用不當，不僅不能起到防治病害的作用，反而會產生很多的毒副作用，且殘留藥物會污染養殖環境，使正常生態系統失調。某些藥物降解后易產生有害的分解產物，如水產消毒劑二氯異氰尿酸鈉及三氯異氰尿酸的分解產物中含有劇毒的氰化合物。
 
 
        研究 表明，隨著抗菌藥物的不斷應用，細菌中耐藥菌株的數量不斷增加。這些細菌的耐藥性可通過耐藥因子（Ｒ－質粒）在人、動物和生態系統中細菌間互相傳遞，使致病菌產生耐藥性，致使感染性疾病的治療更困難。
 
     水產養殖中經常使用的磺胺類、四環素類、喹諾酮類和某些氨基糖甙類抗生素易引起變態反應，當這些抗菌藥物殘留于水產品中進入人體后，使得敏感個體致敏，產生抗體，當這些致敏個體再次接觸這些抗生素時，則會引發變態反應或過敏反應，在臨床上輕者表現為有瘙癢的蕁麻疹、惡心、嘔吐、腹痛和腹瀉等癥狀，嚴重者出現血壓劇烈下降，引起過敏性休克。
 
據臨床資料顯示，人們食用被藥物污染和殘留過高的水產品后，可出現毒性反應和一些后遺癥。如四環素類抗生素會抑制幼兒牙齒發育和骨骼的生長；可抑制骨髓造血細胞線粒體內蛋白質的合成，引起再生障礙性貧血；磺胺類藥物可引起腎臟損害，特別是乙酰化磺胺在酸性尿中溶解降低，析出結晶會引起腎結石；咪唑類驅蟲藥可殘留于肝臟，造成毒性作用，甚至引起遲發性腦病。漁用飼料中添加某些激素類藥物，在人體內蓄積后會使正常生理功能發生紊亂，嚴重時會影響兒童的正常生長發育。在水溫降至２０℃～２５℃時口服，鱸魚的藥物消除半衰期為11.29ｈ，草魚和高倍體鯽魚的消除半衰期分別為11.91ｈ和11.13ｈ，中華絨螯蟹的雄、雌蟹體內消除半衰期分別為（40.341±1.48）ｈ和（22.07±0.31）ｈ。說明在水產動物體內的消除較慢，維持有效濃度時間較長，藥物殘留較嚴重，對人類危害。